Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FGD4Q96M96 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FGD4Q96M96 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FGD4Q96M96 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FGD4Q96M96 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FGD4Q96M96 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FGD4Q96M96 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FGD4Q96M96 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
FGD4Q96M96 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FGD4Q96M96 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FGD4Q96M96 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FGD4Q96M96 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FGD4Q96M96 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FGD4Q96M96 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FGD4Q96M96 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FGD4Q96M96 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
FGD4Q96M96 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
FGD4Q96M96 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FGD4Q96M96 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FGD4Q96M96 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FGD4Q96M96 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FGD4Q96M96 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FGD4Q96M96 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FGD4Q96M96 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FGD4Q96M96 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
FGD4Q96M96 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FGD4Q96M96 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
FGD4Q96M96 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FGD4Q96M96 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FGD4Q96M96 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FGD4Q96M96 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FGD4Q96M96 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FGD4Q96M96 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FGD4Q96M96 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FGD4Q96M96 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FGD4Q96M96 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FGD4Q96M96 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FGD4Q96M96 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FGD4Q96M96 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FGD4Q96M96 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FGD4Q96M96 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FGD4Q96M96 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FGD4Q96M96 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FGD4Q96M96 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FGD4Q96M96 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FGD4Q96M96 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FGD4Q96M96 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FGD4Q96M96 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FGD4Q96M96 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms