Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 NSD2-206ENST00000382895 7827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 ITPR3-202ENST00000605930 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC9.45□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC9.45□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 NRXN1-210ENST00000406316 9375 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 TRPM4-201ENST00000252826 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 SH3PXD2A-203ENST00000369774 11468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC9.44□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
LINC00208Q96KT6 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms