Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TAF4BQ92750 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms