Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
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TMIEQ8NEW7 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
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TMIEQ8NEW7 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
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TMIEQ8NEW7 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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TMIEQ8NEW7 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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TMIEQ8NEW7 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
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TMIEQ8NEW7 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
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TMIEQ8NEW7 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIEQ8NEW7 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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