Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTP6

MICAL3, [F-actin]-monooxygenase MICAL3, humanhuman

Predictions only

Length 2,002 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAL3Q7RTP6 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
MICAL3Q7RTP6 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MICAL3Q7RTP6 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MICAL3Q7RTP6 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MICAL3Q7RTP6 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MICAL3Q7RTP6 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MICAL3Q7RTP6 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MICAL3Q7RTP6 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MICAL3Q7RTP6 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MICAL3Q7RTP6 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MICAL3Q7RTP6 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MICAL3Q7RTP6 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MICAL3Q7RTP6 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MICAL3Q7RTP6 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
MICAL3Q7RTP6 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
MICAL3Q7RTP6 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MICAL3Q7RTP6 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MICAL3Q7RTP6 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MICAL3Q7RTP6 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MICAL3Q7RTP6 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MICAL3Q7RTP6 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MICAL3Q7RTP6 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MICAL3Q7RTP6 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MICAL3Q7RTP6 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MICAL3Q7RTP6 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MICAL3Q7RTP6 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MICAL3Q7RTP6 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MICAL3Q7RTP6 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MICAL3Q7RTP6 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MICAL3Q7RTP6 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MICAL3Q7RTP6 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MICAL3Q7RTP6 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
MICAL3Q7RTP6 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MICAL3Q7RTP6 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MICAL3Q7RTP6 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MICAL3Q7RTP6 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MICAL3Q7RTP6 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MICAL3Q7RTP6 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MICAL3Q7RTP6 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MICAL3Q7RTP6 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MICAL3Q7RTP6 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MICAL3Q7RTP6 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MICAL3Q7RTP6 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MICAL3Q7RTP6 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MICAL3Q7RTP6 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MICAL3Q7RTP6 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MICAL3Q7RTP6 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MICAL3Q7RTP6 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MICAL3Q7RTP6 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MICAL3Q7RTP6 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MICAL3Q7RTP6 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MICAL3Q7RTP6 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
MICAL3Q7RTP6 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MICAL3Q7RTP6 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MICAL3Q7RTP6 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MICAL3Q7RTP6 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MICAL3Q7RTP6 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MICAL3Q7RTP6 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MICAL3Q7RTP6 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MICAL3Q7RTP6 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
MICAL3Q7RTP6 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MICAL3Q7RTP6 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MICAL3Q7RTP6 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MICAL3Q7RTP6 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MICAL3Q7RTP6 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MICAL3Q7RTP6 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MICAL3Q7RTP6 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MICAL3Q7RTP6 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MICAL3Q7RTP6 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MICAL3Q7RTP6 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MICAL3Q7RTP6 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MICAL3Q7RTP6 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MICAL3Q7RTP6 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MICAL3Q7RTP6 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MICAL3Q7RTP6 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MICAL3Q7RTP6 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MICAL3Q7RTP6 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MICAL3Q7RTP6 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MICAL3Q7RTP6 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MICAL3Q7RTP6 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
MICAL3Q7RTP6 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MICAL3Q7RTP6 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MICAL3Q7RTP6 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MICAL3Q7RTP6 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MICAL3Q7RTP6 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MICAL3Q7RTP6 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MICAL3Q7RTP6 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MICAL3Q7RTP6 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MICAL3Q7RTP6 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MICAL3Q7RTP6 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MICAL3Q7RTP6 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MICAL3Q7RTP6 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MICAL3Q7RTP6 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MICAL3Q7RTP6 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MICAL3Q7RTP6 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MICAL3Q7RTP6 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MICAL3Q7RTP6 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MICAL3Q7RTP6 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MICAL3Q7RTP6 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MICAL3Q7RTP6 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms