Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms