Protein–RNA interactions for Protein: Q68D86

CCDC102B, Coiled-coil domain-containing protein 102B, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC102BQ68D86 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC102BQ68D86 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC102BQ68D86 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC102BQ68D86 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC102BQ68D86 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC102BQ68D86 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC102BQ68D86 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC102BQ68D86 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC102BQ68D86 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC102BQ68D86 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC102BQ68D86 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC102BQ68D86 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC102BQ68D86 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC102BQ68D86 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC102BQ68D86 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC102BQ68D86 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC102BQ68D86 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC102BQ68D86 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC102BQ68D86 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC102BQ68D86 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC102BQ68D86 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC102BQ68D86 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC102BQ68D86 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC102BQ68D86 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC102BQ68D86 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC102BQ68D86 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC102BQ68D86 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC102BQ68D86 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC102BQ68D86 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC102BQ68D86 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC102BQ68D86 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC102BQ68D86 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC102BQ68D86 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC102BQ68D86 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC102BQ68D86 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC102BQ68D86 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC102BQ68D86 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC102BQ68D86 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC102BQ68D86 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC102BQ68D86 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC102BQ68D86 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC102BQ68D86 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC102BQ68D86 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC102BQ68D86 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC102BQ68D86 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC102BQ68D86 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC102BQ68D86 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC102BQ68D86 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC102BQ68D86 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC102BQ68D86 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC102BQ68D86 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC102BQ68D86 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC102BQ68D86 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC102BQ68D86 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC102BQ68D86 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC102BQ68D86 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC102BQ68D86 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC102BQ68D86 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC102BQ68D86 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC102BQ68D86 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC102BQ68D86 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC102BQ68D86 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC102BQ68D86 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC102BQ68D86 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC102BQ68D86 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC102BQ68D86 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC102BQ68D86 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC102BQ68D86 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC102BQ68D86 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC102BQ68D86 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC102BQ68D86 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC102BQ68D86 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC102BQ68D86 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC102BQ68D86 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC102BQ68D86 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC102BQ68D86 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC102BQ68D86 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC102BQ68D86 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC102BQ68D86 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC102BQ68D86 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC102BQ68D86 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC102BQ68D86 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC102BQ68D86 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC102BQ68D86 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC102BQ68D86 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC102BQ68D86 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC102BQ68D86 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC102BQ68D86 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC102BQ68D86 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC102BQ68D86 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC102BQ68D86 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC102BQ68D86 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC102BQ68D86 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC102BQ68D86 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC102BQ68D86 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC102BQ68D86 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC102BQ68D86 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC102BQ68D86 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC102BQ68D86 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC102BQ68D86 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms