Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTB9

RNF220, E3 ubiquitin-protein ligase RNF220, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF220Q5VTB9 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF220Q5VTB9 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms