Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT98

PRAMEF20, PRAME family member 20, humanhuman

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Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF20Q5VT98 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PRAMEF20Q5VT98 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRAMEF20Q5VT98 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PRAMEF20Q5VT98 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRAMEF20Q5VT98 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRAMEF20Q5VT98 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRAMEF20Q5VT98 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRAMEF20Q5VT98 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRAMEF20Q5VT98 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRAMEF20Q5VT98 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRAMEF20Q5VT98 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PRAMEF20Q5VT98 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRAMEF20Q5VT98 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRAMEF20Q5VT98 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRAMEF20Q5VT98 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRAMEF20Q5VT98 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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PRAMEF20Q5VT98 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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PRAMEF20Q5VT98 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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PRAMEF20Q5VT98 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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