Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NRF1Q16656 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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NRF1Q16656 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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NRF1Q16656 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NRF1Q16656 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NRF1Q16656 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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NRF1Q16656 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NRF1Q16656 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NRF1Q16656 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NRF1Q16656 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NRF1Q16656 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NRF1Q16656 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NRF1Q16656 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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NRF1Q16656 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NRF1Q16656 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NRF1Q16656 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NRF1Q16656 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NRF1Q16656 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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NRF1Q16656 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NRF1Q16656 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NRF1Q16656 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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NRF1Q16656 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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NRF1Q16656 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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NRF1Q16656 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRF1Q16656 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRF1Q16656 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRF1Q16656 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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