Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
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PDK4Q16654 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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PDK4Q16654 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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PDK4Q16654 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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PDK4Q16654 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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PDK4Q16654 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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PDK4Q16654 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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PDK4Q16654 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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PDK4Q16654 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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PDK4Q16654 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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PDK4Q16654 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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PDK4Q16654 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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