Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SNAPC1Q16533 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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SNAPC1Q16533 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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SNAPC1Q16533 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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SNAPC1Q16533 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
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SNAPC1Q16533 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
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SNAPC1Q16533 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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SNAPC1Q16533 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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SNAPC1Q16533 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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SNAPC1Q16533 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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SNAPC1Q16533 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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SNAPC1Q16533 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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SNAPC1Q16533 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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SNAPC1Q16533 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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SNAPC1Q16533 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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SNAPC1Q16533 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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