Protein–RNA interactions for Protein: Q16526

CRY1, Cryptochrome-1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY1Q16526 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRY1Q16526 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRY1Q16526 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRY1Q16526 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRY1Q16526 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRY1Q16526 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRY1Q16526 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRY1Q16526 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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CRY1Q16526 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRY1Q16526 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRY1Q16526 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
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CRY1Q16526 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
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CRY1Q16526 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRY1Q16526 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
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CRY1Q16526 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRY1Q16526 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRY1Q16526 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
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CRY1Q16526 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRY1Q16526 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRY1Q16526 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRY1Q16526 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRY1Q16526 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRY1Q16526 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRY1Q16526 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRY1Q16526 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRY1Q16526 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRY1Q16526 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRY1Q16526 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRY1Q16526 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRY1Q16526 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRY1Q16526 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRY1Q16526 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRY1Q16526 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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CRY1Q16526 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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CRY1Q16526 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CRY1Q16526 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CRY1Q16526 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CRY1Q16526 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CRY1Q16526 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRY1Q16526 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRY1Q16526 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRY1Q16526 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRY1Q16526 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRY1Q16526 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRY1Q16526 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRY1Q16526 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRY1Q16526 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRY1Q16526 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRY1Q16526 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRY1Q16526 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRY1Q16526 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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