Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIP4Q15650 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
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