Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

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Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
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UBE3CQ15386 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
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UBE3CQ15386 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
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UBE3CQ15386 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
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UBE3CQ15386 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
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