Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
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