Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCARF1Q14162 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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