Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
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SHROOM2Q13796 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SHROOM2Q13796 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
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