Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PMS2P11Q13670 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms