Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms