Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
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