Protein–RNA interactions for Protein: Q13319

CDK5R2, Cyclin-dependent kinase 5 activator 2, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5R2Q13319 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK5R2Q13319 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK5R2Q13319 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDK5R2Q13319 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDK5R2Q13319 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDK5R2Q13319 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDK5R2Q13319 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK5R2Q13319 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK5R2Q13319 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK5R2Q13319 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK5R2Q13319 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK5R2Q13319 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK5R2Q13319 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK5R2Q13319 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK5R2Q13319 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK5R2Q13319 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK5R2Q13319 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK5R2Q13319 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK5R2Q13319 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK5R2Q13319 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK5R2Q13319 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK5R2Q13319 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK5R2Q13319 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK5R2Q13319 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK5R2Q13319 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK5R2Q13319 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK5R2Q13319 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK5R2Q13319 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK5R2Q13319 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK5R2Q13319 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK5R2Q13319 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK5R2Q13319 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK5R2Q13319 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK5R2Q13319 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK5R2Q13319 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK5R2Q13319 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK5R2Q13319 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK5R2Q13319 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK5R2Q13319 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK5R2Q13319 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK5R2Q13319 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK5R2Q13319 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK5R2Q13319 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK5R2Q13319 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK5R2Q13319 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK5R2Q13319 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK5R2Q13319 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK5R2Q13319 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK5R2Q13319 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK5R2Q13319 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK5R2Q13319 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK5R2Q13319 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK5R2Q13319 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK5R2Q13319 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK5R2Q13319 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK5R2Q13319 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK5R2Q13319 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK5R2Q13319 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK5R2Q13319 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK5R2Q13319 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK5R2Q13319 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK5R2Q13319 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK5R2Q13319 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK5R2Q13319 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK5R2Q13319 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK5R2Q13319 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK5R2Q13319 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK5R2Q13319 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK5R2Q13319 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK5R2Q13319 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK5R2Q13319 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK5R2Q13319 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK5R2Q13319 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK5R2Q13319 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK5R2Q13319 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK5R2Q13319 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK5R2Q13319 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK5R2Q13319 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK5R2Q13319 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK5R2Q13319 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK5R2Q13319 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK5R2Q13319 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK5R2Q13319 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK5R2Q13319 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK5R2Q13319 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK5R2Q13319 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK5R2Q13319 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK5R2Q13319 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK5R2Q13319 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK5R2Q13319 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK5R2Q13319 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK5R2Q13319 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK5R2Q13319 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK5R2Q13319 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK5R2Q13319 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK5R2Q13319 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK5R2Q13319 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK5R2Q13319 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK5R2Q13319 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK5R2Q13319 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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