Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
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SKP2Q13309 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SKP2Q13309 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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SKP2Q13309 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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SKP2Q13309 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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SKP2Q13309 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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SKP2Q13309 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKP2Q13309 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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