Protein–RNA interactions for Protein: Q12908

SLC10A2, Ileal sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A2Q12908 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC10A2Q12908 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC10A2Q12908 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC10A2Q12908 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC10A2Q12908 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC10A2Q12908 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC10A2Q12908 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC10A2Q12908 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC10A2Q12908 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC10A2Q12908 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC10A2Q12908 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC10A2Q12908 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC10A2Q12908 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC10A2Q12908 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC10A2Q12908 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC10A2Q12908 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC10A2Q12908 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC10A2Q12908 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC10A2Q12908 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC10A2Q12908 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC10A2Q12908 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC10A2Q12908 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC10A2Q12908 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC10A2Q12908 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC10A2Q12908 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC10A2Q12908 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC10A2Q12908 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC10A2Q12908 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC10A2Q12908 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC10A2Q12908 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC10A2Q12908 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC10A2Q12908 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC10A2Q12908 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC10A2Q12908 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC10A2Q12908 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC10A2Q12908 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC10A2Q12908 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC10A2Q12908 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC10A2Q12908 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC10A2Q12908 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC10A2Q12908 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC10A2Q12908 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC10A2Q12908 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC10A2Q12908 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC10A2Q12908 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC10A2Q12908 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC10A2Q12908 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC10A2Q12908 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SLC10A2Q12908 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SLC10A2Q12908 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC10A2Q12908 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC10A2Q12908 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC10A2Q12908 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC10A2Q12908 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC10A2Q12908 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC10A2Q12908 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC10A2Q12908 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC10A2Q12908 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC10A2Q12908 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SLC10A2Q12908 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC10A2Q12908 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC10A2Q12908 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SLC10A2Q12908 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC10A2Q12908 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC10A2Q12908 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC10A2Q12908 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC10A2Q12908 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC10A2Q12908 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC10A2Q12908 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC10A2Q12908 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC10A2Q12908 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC10A2Q12908 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC10A2Q12908 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC10A2Q12908 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC10A2Q12908 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC10A2Q12908 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC10A2Q12908 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC10A2Q12908 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC10A2Q12908 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC10A2Q12908 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC10A2Q12908 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC10A2Q12908 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC10A2Q12908 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC10A2Q12908 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC10A2Q12908 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC10A2Q12908 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC10A2Q12908 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC10A2Q12908 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC10A2Q12908 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC10A2Q12908 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC10A2Q12908 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC10A2Q12908 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC10A2Q12908 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC10A2Q12908 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC10A2Q12908 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC10A2Q12908 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC10A2Q12908 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC10A2Q12908 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC10A2Q12908 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC10A2Q12908 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms