Protein–RNA interactions for Protein: Q12800

TFCP2, Alpha-globin transcription factor CP2, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFCP2Q12800 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TFCP2Q12800 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TFCP2Q12800 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TFCP2Q12800 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TFCP2Q12800 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TFCP2Q12800 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TFCP2Q12800 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TFCP2Q12800 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TFCP2Q12800 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TFCP2Q12800 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TFCP2Q12800 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TFCP2Q12800 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TFCP2Q12800 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TFCP2Q12800 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TFCP2Q12800 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TFCP2Q12800 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TFCP2Q12800 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TFCP2Q12800 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TFCP2Q12800 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TFCP2Q12800 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TFCP2Q12800 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TFCP2Q12800 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TFCP2Q12800 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TFCP2Q12800 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TFCP2Q12800 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TFCP2Q12800 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TFCP2Q12800 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TFCP2Q12800 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TFCP2Q12800 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TFCP2Q12800 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TFCP2Q12800 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TFCP2Q12800 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TFCP2Q12800 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TFCP2Q12800 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TFCP2Q12800 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TFCP2Q12800 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TFCP2Q12800 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TFCP2Q12800 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TFCP2Q12800 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TFCP2Q12800 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TFCP2Q12800 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TFCP2Q12800 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TFCP2Q12800 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TFCP2Q12800 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TFCP2Q12800 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TFCP2Q12800 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TFCP2Q12800 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TFCP2Q12800 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TFCP2Q12800 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TFCP2Q12800 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TFCP2Q12800 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TFCP2Q12800 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TFCP2Q12800 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TFCP2Q12800 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TFCP2Q12800 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TFCP2Q12800 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TFCP2Q12800 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TFCP2Q12800 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TFCP2Q12800 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TFCP2Q12800 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TFCP2Q12800 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TFCP2Q12800 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TFCP2Q12800 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TFCP2Q12800 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TFCP2Q12800 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TFCP2Q12800 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TFCP2Q12800 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TFCP2Q12800 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TFCP2Q12800 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TFCP2Q12800 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TFCP2Q12800 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TFCP2Q12800 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TFCP2Q12800 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TFCP2Q12800 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
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