Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

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Length 350 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TWF1Q12792 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TWF1Q12792 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TWF1Q12792 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TWF1Q12792 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TWF1Q12792 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TWF1Q12792 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TWF1Q12792 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TWF1Q12792 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TWF1Q12792 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TWF1Q12792 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TWF1Q12792 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TWF1Q12792 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TWF1Q12792 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TWF1Q12792 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
TWF1Q12792 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TWF1Q12792 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
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TWF1Q12792 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
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TWF1Q12792 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TWF1Q12792 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
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