Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms