Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms