Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LTBQ06643 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LTBQ06643 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LTBQ06643 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LTBQ06643 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LTBQ06643 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LTBQ06643 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LTBQ06643 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LTBQ06643 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LTBQ06643 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LTBQ06643 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LTBQ06643 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LTBQ06643 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LTBQ06643 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LTBQ06643 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LTBQ06643 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LTBQ06643 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LTBQ06643 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LTBQ06643 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LTBQ06643 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LTBQ06643 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LTBQ06643 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LTBQ06643 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LTBQ06643 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LTBQ06643 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LTBQ06643 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LTBQ06643 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LTBQ06643 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LTBQ06643 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LTBQ06643 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LTBQ06643 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LTBQ06643 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LTBQ06643 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LTBQ06643 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LTBQ06643 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LTBQ06643 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LTBQ06643 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LTBQ06643 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LTBQ06643 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LTBQ06643 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LTBQ06643 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LTBQ06643 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LTBQ06643 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LTBQ06643 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LTBQ06643 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LTBQ06643 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LTBQ06643 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LTBQ06643 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LTBQ06643 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LTBQ06643 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LTBQ06643 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LTBQ06643 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LTBQ06643 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LTBQ06643 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LTBQ06643 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LTBQ06643 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LTBQ06643 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LTBQ06643 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LTBQ06643 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LTBQ06643 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LTBQ06643 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LTBQ06643 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LTBQ06643 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LTBQ06643 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LTBQ06643 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LTBQ06643 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LTBQ06643 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LTBQ06643 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LTBQ06643 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LTBQ06643 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LTBQ06643 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LTBQ06643 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LTBQ06643 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LTBQ06643 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LTBQ06643 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LTBQ06643 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LTBQ06643 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LTBQ06643 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LTBQ06643 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LTBQ06643 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LTBQ06643 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LTBQ06643 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LTBQ06643 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LTBQ06643 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LTBQ06643 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LTBQ06643 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LTBQ06643 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LTBQ06643 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LTBQ06643 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LTBQ06643 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LTBQ06643 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LTBQ06643 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LTBQ06643 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LTBQ06643 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LTBQ06643 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LTBQ06643 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LTBQ06643 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LTBQ06643 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LTBQ06643 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LTBQ06643 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms