Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABPB1Q06547 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GABPB1Q06547 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
GABPB1Q06547 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
GABPB1Q06547 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GABPB1Q06547 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
GABPB1Q06547 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABPB1Q06547 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABPB1Q06547 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABPB1Q06547 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABPB1Q06547 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABPB1Q06547 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABPB1Q06547 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABPB1Q06547 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABPB1Q06547 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABPB1Q06547 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABPB1Q06547 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABPB1Q06547 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABPB1Q06547 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABPB1Q06547 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABPB1Q06547 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABPB1Q06547 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABPB1Q06547 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABPB1Q06547 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABPB1Q06547 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABPB1Q06547 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABPB1Q06547 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABPB1Q06547 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.4 ms