Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms