Protein–RNA interactions for Protein: P56750

CLDN17, Claudin-17, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN17P56750 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN17P56750 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN17P56750 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN17P56750 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN17P56750 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN17P56750 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN17P56750 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN17P56750 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN17P56750 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN17P56750 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN17P56750 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN17P56750 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN17P56750 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN17P56750 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN17P56750 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN17P56750 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN17P56750 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN17P56750 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN17P56750 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN17P56750 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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