Protein–RNA interactions for Protein: P53985

SLC16A1, Monocarboxylate transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC16A1P53985 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC16A1P53985 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC16A1P53985 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC16A1P53985 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC16A1P53985 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC16A1P53985 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC16A1P53985 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC16A1P53985 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC16A1P53985 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC16A1P53985 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC16A1P53985 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC16A1P53985 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC16A1P53985 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC16A1P53985 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC16A1P53985 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC16A1P53985 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC16A1P53985 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC16A1P53985 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC16A1P53985 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC16A1P53985 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC16A1P53985 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC16A1P53985 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC16A1P53985 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC16A1P53985 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC16A1P53985 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC16A1P53985 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC16A1P53985 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC16A1P53985 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC16A1P53985 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC16A1P53985 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC16A1P53985 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC16A1P53985 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC16A1P53985 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC16A1P53985 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC16A1P53985 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC16A1P53985 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC16A1P53985 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC16A1P53985 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC16A1P53985 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC16A1P53985 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC16A1P53985 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC16A1P53985 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC16A1P53985 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC16A1P53985 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC16A1P53985 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC16A1P53985 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC16A1P53985 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC16A1P53985 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC16A1P53985 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC16A1P53985 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC16A1P53985 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC16A1P53985 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC16A1P53985 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC16A1P53985 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC16A1P53985 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC16A1P53985 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC16A1P53985 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC16A1P53985 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC16A1P53985 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC16A1P53985 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC16A1P53985 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC16A1P53985 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC16A1P53985 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC16A1P53985 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC16A1P53985 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC16A1P53985 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC16A1P53985 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC16A1P53985 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC16A1P53985 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC16A1P53985 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC16A1P53985 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC16A1P53985 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC16A1P53985 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC16A1P53985 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC16A1P53985 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC16A1P53985 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC16A1P53985 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC16A1P53985 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC16A1P53985 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC16A1P53985 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC16A1P53985 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC16A1P53985 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC16A1P53985 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC16A1P53985 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC16A1P53985 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC16A1P53985 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC16A1P53985 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC16A1P53985 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC16A1P53985 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC16A1P53985 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC16A1P53985 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC16A1P53985 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC16A1P53985 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC16A1P53985 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC16A1P53985 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC16A1P53985 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC16A1P53985 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC16A1P53985 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC16A1P53985 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC16A1P53985 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms