Protein–RNA interactions for Protein: P48764

SLC9A3, Sodium/hydrogen exchanger 3, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A3P48764 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC9A3P48764 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC9A3P48764 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC9A3P48764 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC9A3P48764 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC9A3P48764 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC9A3P48764 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC9A3P48764 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC9A3P48764 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC9A3P48764 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC9A3P48764 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC9A3P48764 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC9A3P48764 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC9A3P48764 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC9A3P48764 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC9A3P48764 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC9A3P48764 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC9A3P48764 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC9A3P48764 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC9A3P48764 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC9A3P48764 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC9A3P48764 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC9A3P48764 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC9A3P48764 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC9A3P48764 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC9A3P48764 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC9A3P48764 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC9A3P48764 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC9A3P48764 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC9A3P48764 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC9A3P48764 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC9A3P48764 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC9A3P48764 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC9A3P48764 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC9A3P48764 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC9A3P48764 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC9A3P48764 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC9A3P48764 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC9A3P48764 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC9A3P48764 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC9A3P48764 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC9A3P48764 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC9A3P48764 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC9A3P48764 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC9A3P48764 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC9A3P48764 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC9A3P48764 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC9A3P48764 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC9A3P48764 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC9A3P48764 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC9A3P48764 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC9A3P48764 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC9A3P48764 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC9A3P48764 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC9A3P48764 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC9A3P48764 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC9A3P48764 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC9A3P48764 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC9A3P48764 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC9A3P48764 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC9A3P48764 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC9A3P48764 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC9A3P48764 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC9A3P48764 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC9A3P48764 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC9A3P48764 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC9A3P48764 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC9A3P48764 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC9A3P48764 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC9A3P48764 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC9A3P48764 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC9A3P48764 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC9A3P48764 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC9A3P48764 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC9A3P48764 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC9A3P48764 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC9A3P48764 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC9A3P48764 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC9A3P48764 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC9A3P48764 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC9A3P48764 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC9A3P48764 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC9A3P48764 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC9A3P48764 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC9A3P48764 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC9A3P48764 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC9A3P48764 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC9A3P48764 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC9A3P48764 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC9A3P48764 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC9A3P48764 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC9A3P48764 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC9A3P48764 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC9A3P48764 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC9A3P48764 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC9A3P48764 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC9A3P48764 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC9A3P48764 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC9A3P48764 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC9A3P48764 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms