Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ME1P48163 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ME1P48163 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ME1P48163 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ME1P48163 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ME1P48163 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ME1P48163 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ME1P48163 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ME1P48163 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ME1P48163 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ME1P48163 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ME1P48163 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ME1P48163 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ME1P48163 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ME1P48163 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ME1P48163 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ME1P48163 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ME1P48163 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ME1P48163 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ME1P48163 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ME1P48163 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ME1P48163 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ME1P48163 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ME1P48163 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ME1P48163 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ME1P48163 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ME1P48163 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ME1P48163 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ME1P48163 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ME1P48163 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ME1P48163 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ME1P48163 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ME1P48163 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ME1P48163 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ME1P48163 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ME1P48163 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ME1P48163 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ME1P48163 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ME1P48163 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ME1P48163 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ME1P48163 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ME1P48163 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ME1P48163 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ME1P48163 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ME1P48163 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ME1P48163 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ME1P48163 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ME1P48163 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ME1P48163 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ME1P48163 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ME1P48163 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ME1P48163 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ME1P48163 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ME1P48163 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ME1P48163 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ME1P48163 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ME1P48163 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ME1P48163 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ME1P48163 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ME1P48163 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ME1P48163 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ME1P48163 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ME1P48163 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ME1P48163 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ME1P48163 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ME1P48163 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ME1P48163 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ME1P48163 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ME1P48163 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ME1P48163 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ME1P48163 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ME1P48163 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ME1P48163 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ME1P48163 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ME1P48163 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ME1P48163 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ME1P48163 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ME1P48163 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ME1P48163 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ME1P48163 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ME1P48163 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ME1P48163 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ME1P48163 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ME1P48163 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ME1P48163 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ME1P48163 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ME1P48163 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ME1P48163 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ME1P48163 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ME1P48163 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ME1P48163 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ME1P48163 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ME1P48163 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ME1P48163 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ME1P48163 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ME1P48163 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ME1P48163 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ME1P48163 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ME1P48163 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ME1P48163 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms