Protein–RNA interactions for Protein: P40121

CAPG, Macrophage-capping protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPGP40121 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPGP40121 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPGP40121 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPGP40121 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPGP40121 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPGP40121 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
CAPGP40121 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAPGP40121 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAPGP40121 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAPGP40121 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAPGP40121 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAPGP40121 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAPGP40121 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAPGP40121 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAPGP40121 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAPGP40121 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAPGP40121 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAPGP40121 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAPGP40121 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAPGP40121 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAPGP40121 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAPGP40121 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAPGP40121 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAPGP40121 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAPGP40121 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAPGP40121 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAPGP40121 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAPGP40121 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAPGP40121 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CAPGP40121 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAPGP40121 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CAPGP40121 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAPGP40121 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAPGP40121 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAPGP40121 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAPGP40121 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAPGP40121 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAPGP40121 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAPGP40121 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAPGP40121 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAPGP40121 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAPGP40121 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAPGP40121 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPGP40121 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPGP40121 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPGP40121 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPGP40121 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPGP40121 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPGP40121 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPGP40121 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPGP40121 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPGP40121 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPGP40121 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPGP40121 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPGP40121 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPGP40121 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPGP40121 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPGP40121 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPGP40121 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPGP40121 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPGP40121 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPGP40121 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPGP40121 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPGP40121 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPGP40121 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPGP40121 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPGP40121 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPGP40121 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPGP40121 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPGP40121 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPGP40121 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPGP40121 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPGP40121 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPGP40121 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPGP40121 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPGP40121 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPGP40121 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPGP40121 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPGP40121 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPGP40121 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPGP40121 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPGP40121 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPGP40121 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPGP40121 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPGP40121 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPGP40121 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPGP40121 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPGP40121 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPGP40121 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPGP40121 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPGP40121 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPGP40121 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPGP40121 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPGP40121 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPGP40121 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPGP40121 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPGP40121 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPGP40121 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPGP40121 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPGP40121 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms