Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GGCXP38435 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GGCXP38435 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GGCXP38435 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GGCXP38435 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GGCXP38435 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GGCXP38435 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GGCXP38435 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GGCXP38435 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GGCXP38435 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GGCXP38435 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GGCXP38435 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GGCXP38435 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GGCXP38435 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GGCXP38435 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GGCXP38435 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GGCXP38435 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GGCXP38435 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GGCXP38435 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GGCXP38435 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GGCXP38435 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GGCXP38435 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GGCXP38435 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GGCXP38435 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GGCXP38435 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GGCXP38435 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GGCXP38435 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GGCXP38435 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GGCXP38435 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GGCXP38435 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GGCXP38435 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GGCXP38435 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GGCXP38435 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GGCXP38435 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GGCXP38435 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GGCXP38435 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GGCXP38435 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GGCXP38435 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GGCXP38435 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GGCXP38435 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GGCXP38435 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GGCXP38435 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GGCXP38435 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GGCXP38435 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GGCXP38435 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GGCXP38435 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GGCXP38435 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GGCXP38435 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GGCXP38435 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GGCXP38435 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GGCXP38435 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GGCXP38435 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GGCXP38435 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GGCXP38435 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GGCXP38435 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GGCXP38435 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GGCXP38435 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GGCXP38435 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GGCXP38435 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GGCXP38435 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GGCXP38435 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GGCXP38435 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GGCXP38435 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GGCXP38435 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GGCXP38435 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GGCXP38435 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GGCXP38435 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GGCXP38435 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GGCXP38435 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GGCXP38435 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GGCXP38435 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GGCXP38435 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GGCXP38435 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GGCXP38435 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GGCXP38435 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GGCXP38435 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GGCXP38435 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GGCXP38435 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GGCXP38435 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GGCXP38435 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GGCXP38435 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GGCXP38435 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GGCXP38435 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GGCXP38435 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GGCXP38435 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GGCXP38435 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GGCXP38435 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GGCXP38435 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GGCXP38435 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GGCXP38435 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GGCXP38435 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GGCXP38435 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GGCXP38435 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GGCXP38435 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GGCXP38435 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GGCXP38435 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GGCXP38435 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GGCXP38435 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GGCXP38435 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GGCXP38435 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms