Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms