Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PSMB4P28070 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 159.1 ms