Protein–RNA interactions for Protein: P12074

COX6A1, Cytochrome c oxidase subunit 6A1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX6A1P12074 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX6A1P12074 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX6A1P12074 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms