Protein–RNA interactions for Protein: P0C7I6

CCDC159, Coiled-coil domain-containing protein 159, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC159P0C7I6 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC159P0C7I6 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC159P0C7I6 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC159P0C7I6 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC159P0C7I6 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC159P0C7I6 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC159P0C7I6 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC159P0C7I6 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC159P0C7I6 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC159P0C7I6 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC159P0C7I6 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC159P0C7I6 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC159P0C7I6 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC159P0C7I6 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC159P0C7I6 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC159P0C7I6 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC159P0C7I6 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC159P0C7I6 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC159P0C7I6 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC159P0C7I6 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC159P0C7I6 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC159P0C7I6 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC159P0C7I6 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC159P0C7I6 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC159P0C7I6 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC159P0C7I6 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC159P0C7I6 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC159P0C7I6 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC159P0C7I6 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC159P0C7I6 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC159P0C7I6 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC159P0C7I6 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC159P0C7I6 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC159P0C7I6 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC159P0C7I6 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC159P0C7I6 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC159P0C7I6 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC159P0C7I6 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC159P0C7I6 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC159P0C7I6 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC159P0C7I6 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC159P0C7I6 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC159P0C7I6 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC159P0C7I6 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC159P0C7I6 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC159P0C7I6 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC159P0C7I6 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC159P0C7I6 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC159P0C7I6 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC159P0C7I6 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC159P0C7I6 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC159P0C7I6 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC159P0C7I6 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC159P0C7I6 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC159P0C7I6 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC159P0C7I6 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC159P0C7I6 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC159P0C7I6 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC159P0C7I6 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC159P0C7I6 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC159P0C7I6 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC159P0C7I6 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC159P0C7I6 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC159P0C7I6 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC159P0C7I6 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC159P0C7I6 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC159P0C7I6 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC159P0C7I6 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC159P0C7I6 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC159P0C7I6 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC159P0C7I6 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC159P0C7I6 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC159P0C7I6 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC159P0C7I6 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC159P0C7I6 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC159P0C7I6 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC159P0C7I6 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC159P0C7I6 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC159P0C7I6 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC159P0C7I6 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC159P0C7I6 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC159P0C7I6 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC159P0C7I6 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC159P0C7I6 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC159P0C7I6 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC159P0C7I6 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC159P0C7I6 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC159P0C7I6 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC159P0C7I6 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC159P0C7I6 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC159P0C7I6 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC159P0C7I6 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC159P0C7I6 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC159P0C7I6 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC159P0C7I6 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC159P0C7I6 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC159P0C7I6 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC159P0C7I6 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC159P0C7I6 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC159P0C7I6 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms