Protein–RNA interactions for Protein: P04280

PRB1, Basic salivary proline-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB1P04280 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRB1P04280 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRB1P04280 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRB1P04280 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRB1P04280 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRB1P04280 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRB1P04280 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRB1P04280 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRB1P04280 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRB1P04280 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRB1P04280 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRB1P04280 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRB1P04280 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRB1P04280 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRB1P04280 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRB1P04280 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRB1P04280 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRB1P04280 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRB1P04280 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRB1P04280 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRB1P04280 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRB1P04280 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRB1P04280 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRB1P04280 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRB1P04280 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRB1P04280 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRB1P04280 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRB1P04280 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRB1P04280 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRB1P04280 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PRB1P04280 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRB1P04280 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PRB1P04280 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRB1P04280 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRB1P04280 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRB1P04280 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PRB1P04280 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRB1P04280 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRB1P04280 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRB1P04280 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRB1P04280 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PRB1P04280 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRB1P04280 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRB1P04280 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PRB1P04280 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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PRB1P04280 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRB1P04280 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRB1P04280 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRB1P04280 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRB1P04280 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRB1P04280 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRB1P04280 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRB1P04280 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRB1P04280 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRB1P04280 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRB1P04280 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRB1P04280 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRB1P04280 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRB1P04280 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRB1P04280 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRB1P04280 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRB1P04280 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRB1P04280 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRB1P04280 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRB1P04280 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRB1P04280 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PRB1P04280 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRB1P04280 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRB1P04280 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRB1P04280 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRB1P04280 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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PRB1P04280 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRB1P04280 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRB1P04280 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PRB1P04280 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRB1P04280 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRB1P04280 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRB1P04280 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRB1P04280 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRB1P04280 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRB1P04280 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRB1P04280 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRB1P04280 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PRB1P04280 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRB1P04280 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRB1P04280 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRB1P04280 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PRB1P04280 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PRB1P04280 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRB1P04280 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PRB1P04280 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PRB1P04280 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRB1P04280 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRB1P04280 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRB1P04280 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRB1P04280 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRB1P04280 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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