Protein–RNA interactions for Protein: O95487

SEC24B, Protein transport protein Sec24B, humanhuman

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24BO95487 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEC24BO95487 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEC24BO95487 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEC24BO95487 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEC24BO95487 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEC24BO95487 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEC24BO95487 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEC24BO95487 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEC24BO95487 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEC24BO95487 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEC24BO95487 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEC24BO95487 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEC24BO95487 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEC24BO95487 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEC24BO95487 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEC24BO95487 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEC24BO95487 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEC24BO95487 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEC24BO95487 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEC24BO95487 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SEC24BO95487 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEC24BO95487 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEC24BO95487 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEC24BO95487 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEC24BO95487 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEC24BO95487 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEC24BO95487 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEC24BO95487 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SEC24BO95487 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEC24BO95487 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEC24BO95487 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEC24BO95487 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEC24BO95487 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEC24BO95487 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEC24BO95487 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEC24BO95487 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEC24BO95487 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SEC24BO95487 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEC24BO95487 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEC24BO95487 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEC24BO95487 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEC24BO95487 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEC24BO95487 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEC24BO95487 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEC24BO95487 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEC24BO95487 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEC24BO95487 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEC24BO95487 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEC24BO95487 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEC24BO95487 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEC24BO95487 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEC24BO95487 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEC24BO95487 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEC24BO95487 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEC24BO95487 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SEC24BO95487 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEC24BO95487 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SEC24BO95487 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEC24BO95487 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEC24BO95487 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEC24BO95487 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEC24BO95487 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEC24BO95487 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEC24BO95487 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEC24BO95487 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SEC24BO95487 AC073575.1-201ENST00000551125 596 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEC24BO95487 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEC24BO95487 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEC24BO95487 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SEC24BO95487 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEC24BO95487 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEC24BO95487 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SEC24BO95487 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEC24BO95487 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SEC24BO95487 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEC24BO95487 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEC24BO95487 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEC24BO95487 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEC24BO95487 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEC24BO95487 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEC24BO95487 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEC24BO95487 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEC24BO95487 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEC24BO95487 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEC24BO95487 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEC24BO95487 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEC24BO95487 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEC24BO95487 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEC24BO95487 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEC24BO95487 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEC24BO95487 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEC24BO95487 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEC24BO95487 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEC24BO95487 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEC24BO95487 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEC24BO95487 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEC24BO95487 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEC24BO95487 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEC24BO95487 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEC24BO95487 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms