Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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