Protein–RNA interactions for Protein: A4D0V7

CPED1, Cadherin-like and PC-esterase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPED1A4D0V7 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CPED1A4D0V7 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms