Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D7

PLXND1, Plexin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXND1Q9Y4D7 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLXND1Q9Y4D7 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PLXND1Q9Y4D7 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PLXND1Q9Y4D7 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PLXND1Q9Y4D7 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLXND1Q9Y4D7 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLXND1Q9Y4D7 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLXND1Q9Y4D7 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLXND1Q9Y4D7 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLXND1Q9Y4D7 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLXND1Q9Y4D7 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLXND1Q9Y4D7 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PLXND1Q9Y4D7 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
PLXND1Q9Y4D7 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
PLXND1Q9Y4D7 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
PLXND1Q9Y4D7 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PLXND1Q9Y4D7 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms