Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
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SH3BP1Q9Y3L3 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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SH3BP1Q9Y3L3 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
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SH3BP1Q9Y3L3 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
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SH3BP1Q9Y3L3 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
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SH3BP1Q9Y3L3 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
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SH3BP1Q9Y3L3 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SH3BP1Q9Y3L3 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
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