Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms