Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNS2

COPS3, COP9 signalosome complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS3Q9UNS2 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
COPS3Q9UNS2 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms