Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms